The microbiological signature of human cutaneous leishmaniasis lesions exhibits restricted bacterial diversity compared to healthy skin

Localised cutaneous leishmaniasis (LCL) is the most common form of cutaneous leishmaniasis characterised by single or multiple painless chronic ulcers, which commonly presents with secondary bacterial infection. Previous culture-based studies have found staphylococci, streptococci, and opportunistic pathogenic bacteria in LCL lesions, but there have been no comparisons to normal skin. In addition, this approach has strong bias for determining bacterial composition. The present study tested the hypothesis that bacterial communities in LCL lesions differ from those found on healthy skin (HS). Using a high throughput amplicon sequencing approach, which allows for better populational evaluation due to greater depth coverage and the Quantitative Insights Into Microbial Ecology pipeline, we compared the microbiological signature of LCL lesions with that of contralateral HS from the same individuals.Streptococcus, Staphylococcus,Fusobacterium and other strict or facultative anaerobic bacteria composed the LCL microbiome. Aerobic and facultative anaerobic bacteria found in HS, including environmental bacteria, were significantly decreased in LCL lesions (p < 0.01). This paper presents the first comprehensive microbiome identification from LCL lesions with next generation sequence methodology and shows a marked reduction of bacterial diversity in the lesions.

Identificación de especies de Malassezia aisladas de piel sana en pobladores de Lima, Perú / Identification of Malassezia species isolated from healthy skin in residents of Lima, Peru

Objetivo: Identificar las especies de Malassezia en zonas seborreicas de piel sana en población limeña. Diseño: Estudio descriptivo transversal. Lugar: Instituto de Medicina Tropical æDaniel Alcides CarriónÆ, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Lima, Perú. Participantes: Pobladores asintomáticos. Intervenciones: Empleando la técnica de Mariat y Adan-Campos, se recolectó muestras de piel de 129 pobladores asintomáticos de diversos distritos de la ciudad de Lima. El aislamiento de Malassezia se realizó en medio Dixon modificado e incubado a 32 grados centígrados por 7 días, la identificación de las colonias por sus características macro y micromorfológicas, y la tipificación mediante el estudio de las propiedades bioquímicas y fisiológicas según la técnica de Guillot y col. Principales medidas de resultados: Especie de Malassezia, sexo, edad y región anatómica. Resultados: Se aisló Malassezia spp en 43,4 por ciento de los pobladores, obteniéndose 49,2 por ciento en varones y 37,5 por ciento en mujeres. De las diferentes regiones corporales, 68 cultivos fueron positivos: cuero cabelludo 31 (45,6 por ciento), espalda 36 (52,9 por ciento) y región frontal 1 (1,5 por ciento). El grupo etario con mayor frecuencia de aislamientos (47,2 por ciento) fue el de 14 a 25 años (adolescentes jóvenes). M. slooffiae fue encontrado en 83,8 por ciento y M. obtusa en 16,2 por ciento de los casos. Conclusiones: Se encontró Malassezia spp. en la piel humana sana. M. slooffiae fue la especie predominante de los casos positivos (83,8 por ciento) seguido de M. obtusa (16,2 por ciento)...

Objective: To identify Malassezia species in healthy skin seborrhea areas in Lima inhabitants. Design: Cross-sectional study. Setting: Daniel Alcides Carrion Tropical Medicine Institute, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Lima, Peru. Participants: Asymptomatic persons. Interventions: Skin samples were collected from 129 asymptomatic residents of several districts of Lima city using Mariat and Adan-CamposÆ technique. Malassezia isolation was performed in modified Dixon medium and incubated at 32 grades centigrades for 7 days. Colonies were identified by macro and micro morphological characteristics and typing was determined by biochemical and physiological properties using GuillotÆs technique. Main outcome measures: Malassezia species, participantsÆ gender, age and anatomical region. Results: Malassezia spp was isolated in 43.4 per cent of the residents, 49.2 per cent in men and 37.5 per cent in women. From various body regions 68 cultures were positive: scalp 31 (45.6 per cent), back 36 (52.9 per cent) and frontal region 1 (1.5 per cent). Isolates most common age group (47.2 per cent) was that of adolescents-young (14-25 year-old). M. slooffiae was found in 83.8 per cent and M. obtusa in 16.2 per cent of cases. Conclusions: Malassezia spp. was present in healthy human skin. M. slooffiae was the predominant species in positive cases (83.8 per cent) followed by M. obtusa (16.2 per cent)...

Colonización bacteriana de piel sana versus quemada de niños bajo 15 años tratados en COANIQUEM, Santiago de Chile / Bacterial colonization in areas of burnt skin and healthy children younger than 15 years, seen COANIQUEM, Santiago, Chile

Bacterial colonization in patients with burns skin without infection and outpatient management has been poorly studied. Objective: To quantify and identify the type of bacteria that colonize healthy body areas homologous location of the skin in children from 1 to 15 years, seen COANIQUEM, Santiago, Chile. Per patient, we studied 204 samples from each zone. The isolated microorganisms were S. epidermidis 35, 3%; others Staphylococcus coagulase negative, 25.8%; S. aureus, 4.4%; and S. viridans group 1.4%. In the subgroup of children who had a count between 1 and 1000 cfu, there was a higher proportion of cfu in burned skin healthy skin (p = 0.0359). The association between depth of the lesion and the bacterial count obtained p = 0.034. Conclusion: In outpatient treatment, the microorganisms are expected in healthy skin, burned skin is evident in lower counts probably associated with epithelial damage.

La colonización bacteriana de la piel de pacientes quemados, sin infección y de manejo ambulatorio, ha sido escasamente estudiada. Objetivo: Cuantificar e identificar el tipo de bacterias que colonizan las zonas cruentas y las zonas sanas de localización homóloga de la piel, en niños entre uno y 15 años de edad que son tratados de forma ambulatoria en la Corporación de Ayuda al Niño Quemado (COANIQUEM) en Santiago de Chile. Pacientes y Métodos: Se estudiaron 204 pacientes quemados en los que se tomó una muestra para cultivo desde la zona de la quemadura y otra desde el sitio homólogo sin quemadura. Resultados: Las especies bacterianas aisladas desde ambos tipos de muestra fueron similares: Staphylococcus epidermidis; otras especies de Staphylococcus coagulasa negativa; Staphylococcus aureus, y Streptococcus grupo viridans. El recuento bacteriano de uno a 999 ufc/ 10,5 cm² fue significativamente superior en las muestras de piel sana (p = 0,0359). La asociación entre mayor profundidad de la lesión y el menor recuento bacteriano obtuvo un p = 0,034. Conclusión: En niños quemados de entre uno y 15 años, de manejo ambulatorio, los microorganismos que colonizan la zona quemada fueron los mismos que colonizan la piel sana, pero en recuento inferior.

Colonización por levaduras en piel sana de recien nacidos / Yeast colonization on healthy skin in newborns

En el niño recién nacido la colonización por especies de levaduras puede ser el precursor de una infección clínica. En esta investigación se evaluó la colonización por levaduras en piel de neonatos nacidos a término en las primeras 48 horas del nacimiento. Las muestras de piel, de 100 niños, se tomaron de diferentes regiones anatómicas. Se empleó el método de la impronta con cinta plástica transparente. Se realizó un examen directo con azul de metileno (0,25 por ciento) y se cultivó en los medios Sabouraud Dextrosa Agar y Dixon con antibióticos. La identificación de los aislados se hizo según metodología clásica. Los resultados indican que los neonatos presentaron una colonización por levaduras en un 45 por ciento. Se observó una colonización baja por Malassezia furfur (5 por ciento) y el predominio de Candida parapsilosis (87,9 por ciento). Esta especie de Candida fue aislada en un 54,2 por ciento cuando el nacimiento fue por cesárea y, 33,7 por ciento cuando fue por parto. El alto porcentaje de colonización por C. parapsilosis tanto en los niños nacidos por parto como por cesárea podría deberse a la trasmisión horizontal a partir de las manos del personal de salud que los atiende

In the newborn, colonization by yeast species may be the precursor for a clinical infection. This study assessed yeast colonization on the skin of term infants during the first 48 hours after birth. Skin samples of 100 children were taken from different anatomical regions. The stamp method with transparent plastic tape was used. A direct test with methylene blue (0.25 percent) was made and cultured in Sabouraud dextrose agar and Dixon media with antibiotics. Isolates were identified according to classic methodology. Results indicate that 45 percent of the newborns had yeast colonies. Low colonization by Malassezia furfur (5 percent) and the predominance of Candida parapsilosis (87.9 percent) were observed. This species of Candida was isolated in 54.2 percent of births by caesarean section and 33.7 percent of natural births. The high rate of colonization by C. parapsilosis in children born by caesarean as well as normal delivery could be due to horizontal transmission from the hands of health workers taking care of them